Diagnóstico molecular de Phytophtohora cinnamomi asociado a la pudrición radicular en zonas productoras de aguacate en Ecuador

Abstract

Phytophthora cinnamomi Rands está asociado con la pudrición radicular, una de las enfermedades más importantes en el cultivo de aguacate (Persea americana Mill.) debido a que ocasiona marchitez progresiva hasta provocar la muerte del árbol. El objetivo de este estudio fue identificar molecularmente la presencia de P. cinnamomi con la técnica PCR-RFLP, en plantaciones de aguacate en dos zonas productoras del Ecuador. Con este fin, se obtuvieron muestras de raíces de árboles con sintomatología de pudrición radicular en las zonas de producción. A partir de estas se obtuvieron diez aislamientos donde se identificó morfológicamente a Phytophthora sp. Para la distinción de especies de Phythophthora se realizó un análisis molecular con marcadores en la región ITS de ADN ribosomal (ADNr). La digestión del gragmento ITS obtenido por PCR con la enzima TaqI permitió confirmar la presencia de P. cinnamomi en los aislamientos y, por lo tanto, asociar su presencia con la pudrición radicular en las zonas de producción muestreadas.

One of the most damaging diseases in cultivation of avocado (Persea Americana Mill.) is root rot associated with Phytophthora cinnamomi Rands. This disease causes progressive wilt and even death of the tree. The objective of this study was to identify the presence of P. cinnamomi in two productive areas of avocado in Ecuador using the molecular technique PCR-RFLP. Tree root samples were obtained with root rot symptoms in the production areas, from which 10 isolates were morphologically identified with Phytophthora spp. Infection. To distinguish among the various Phytophthora species, a molecular analysis was performed using molecular markers in the ITS region of the ribosomal DNA (rDNA). The ITS digestion fragment obtained by PCR with the TaqI enzyme confirmed the presence of Phytophthora cinnamomi in the isolated samples, and its association with root rot in the sampled production areas.